FMIPA Unnes memiliki empat gedung laboratorium berlantai tiga yang digunakan untuk memfasilitasi kegiatan laboratorium, yaitu:

  • Gedung D1 Lantai 3 dan D2 Lantai 1 (Laboratorium Ilmu Komputer);
  • Gedung D1 Lantai 1 (Laboratorium IPA);
  • Gedung D8 (Laboratorium Kimia);
  • Gedung D9 (Laboratorium Fisika);
  • Gedung D10 (Laboratorium Matematika); dan
  • Gedung D11 (Laboratorium Biologi).

Setiap laboratorium tersebut telah dilengkapi dengan berbagai macam alat & bahan laboratorium yang digunakan untuk menunjang kegiatan praktikum sesuai dengan kebutuhan masing-masing.