Untuk memfasilitasi kegiatan perkuliahan, FMIPA Unnes memiliki empat gedung berlantai tiga, yaitu Gedung D1, D2, D3, dan D4. Pada setiap ruang kuliah telah tersedia LCD Proyektor sebagai media penunjang perkuliahan. Sebagian besar ruang juga telah dilengkapi dengan Air Conditioner (AC), sehingga ruang kuliah terasa lebih nyaman dan kegiatan perkuliahan dapat terlaksana dengan lebih kondusif.