Organisasi Kemahasiswaan dari Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam terdiri dari 8 (delapan) Lembaga Kemahasiswaan, 7 (tujuh) Unit Kegiatan Mahasiswa, dan 23 (dua puluh tiga) Badan Semi Otonom.

Lembaga Kemahasiswaan terdiri dari:

  • Badan Eksekutif Mahasiswa Fakultas (BEMF)
  • Dewan Perwakilan Mahasiswa Fakultas (DPMF)
  • Lembaga Kemahasiswaan di tingkat jurusan.

Adapun Lembaga di tingkat jurusan tersebut diantaranya :

  • Himpunan Mahasiswa Matematika
  • Himpunan Mahasiswa Biologi
  • Himpunan Mahasiswa Kimia
  • Himpunan Mahasiswa Fisika
  • Himpunan Mahasiswa IPA
  • Himpunan Mahasiswa Ilkom.

Setiap himpunan mahasiswa (Hima) di jurusan memiliki lembaga kemahasiswaan yang setara yaitu Badan Pengawas Hima (BPH).

Unit Kegiatan Mahasiswa (UKM) yang ada di Fakultas matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam terdiri dari:

  • Pramuka
  • Student Scientific Center
  • Bina Vokalia
  • Forum Mahasiswa Islam
  • Ikatan Mahasiswa Bidikmisi
  • Mathematics English Club, dan Kewirausahaan.

Badan Semi Otonom (BSO) yang ada di Fakultas matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam sebanyak 23 (dua puluh tiga) yang dimiliki oleh  Hima di masing-masing jurusan yaitu:

  1. Mathematics Study Club
  2. Mathematics English Club
  3. Mathematics Jurnalistik Club
  4. Kelompok Ilmiah Matematika
  5. SIGMA
  6. The Mate
  7. Palafi (Pecinta Alam Fisika)
  8. Kosmik (Kelompok Studi Fisika)
  9. FKIF (Forum Kajian Islam Fisika)
  10. Pelatuk Bird Study Club
  11. Jasmina Study Center
  12. Familia
  13. Cempaka Bio Farm
  14. Chevent (Pecinta Alam)
  15. Kelompok Ilmiah Kimia
  16. Sie Kerohanian Islam
  17. Morse
  18. KIIT (Keilmiahan)
  19. Sceva (Pecinta Alam)
  20. Alhusna
  21. Screenshot
  22. Palatikom
  23. I-Secret.